一般说来，从受孕日(受精日)开始的大约3个礼拜期间，这时期所使用的药，一般都不会对胎儿造成影响。不过，从怀孕2个半月到4个月初期为止，是胎儿身体器官形成的时期，在这段时期，有时候会因为所服用的药量和种类因素，而引起胎儿身体畸形的危险。

在胎儿身体器官大致形成的怀孕4个半月以后，就没有造成畸形之疑虑，不过，却可能会影响胎儿各器官的发育。妊娠后，孕妇各个系统和器官均发生了一些变化，使许多药物在体内的过程非但不同于非孕期，而且还能通过胎盘到达胎儿体内，影响胎儿，或通过乳汁影响新生儿。因此，近年来对于孕妇用药已引起了广泛的重视。药物对胎儿、新生儿的影响，取决于药物的种类、剂量、持续作用时间以及通过胎盘的速度和程度，特别取决于胎儿的发育处于什么阶段及其药物的反应。

在给孕妇用药时，必须考虑到药物对胎儿、新生儿的影响：

致畸：孕妇用药引起胎儿畸形，多发生于妊娠12周以内，而以8周内影响最大。此期，胎儿正处于胚胎相继分化和联合阶段，各系统尚未完全形成，如妊娠早期，使用某些种类的抗早孕反应药（如安定、氯丙嗪等），某些保胎的激素类药（雌激素等），部分抗生素（氯霉素、抗滴虫药、卡那霉素等），可能导致胎儿畸形。

致癌：目前已证实乙烯雌酚和乙烷雌酚有致癌作用。有报导，用过乙烯雌酚保胎的妇女所生女孩中，有0.14-1.4%成长到12-24岁之间，可能发生阴道透明细胞癌。此外，还可能引起流产、死胎和发育畸形。

发育缺陷：孕早期口服四环素，可能引起小肢体畸形，孕16周后用药，可致牙质发育不全或骨质发育迟缓、乳牙发黄。

呼吸抑制：吗啡、哌替啶，可抑制新生儿呼吸中枢，甚至死亡；利血平可引起新生儿鼻塞而导致呼吸困难。以上用药，在胎儿娩出前1小时尽量不要应用。