恶心呕吐：大多数化疗药都有恶心呕吐等副作用，但程度不同。顺铂（DDP）、氮芥（HN2）、阿霉素（ADM）、表阿霉素（EPI）相对较重，而丝裂霉素（MMC）、博来霉素（BLM）、紫杉醇（PTX）、泰索帝（TXT）则较少出现恶心呕吐。

 骨髓抑制：大多数化疗药都有，其中紫杉醇（PTX）、泰索帝（TXT）、诺维本（NVB）、依托泊甙（VP-16）、卡铂（CBP）、异环磷酰胺（IFO）、甲氨喋呤（MTX）、阿霉素（ADM）较为明显。一般先出现白细胞中的中性粒细胞减少，其次出现血小板减少。丝裂霉素、健择可以先出现血小板减少。

 腹泻：草酸铂（L-OHP）、开普拓（CPT-11）、5－FU、羟基喜树碱、希罗达有可能出现腹泻。

 便秘：诺维本（NVB）、长春新碱（VCR）、长春地辛（VDS）、以及中枢性镇吐药都可以导致便秘。

 心脏毒性：阿霉素（ADM）、表阿霉素（EPI）、吡喃阿霉素（THP）、紫杉醇（PTX）有心脏毒性，临床可以表现为胸闷、无力、心律不齐等。

 脱发：几乎所有化疗药都可以导致脱发，但轻重不同，轻的仅少量脱发，重的可全部脱落。阿霉素、表阿霉素、吡喃阿霉素、紫杉醇几乎100％导致全脱。

 色素沉着：5－FU、博来霉素、平阳霉素可以导致色素在皮肤、指甲沉积，出现皮肤变黑或指甲变黑。

 神经毒性：草酸铂、诺维本、紫杉醇、泰索帝、长春碱类、依托泊甙（VP-16）都可以产生周围神经毒性，患者感觉手或脚发麻、四肢肌肉酸痛，也有人出现唇、舌发麻，极少数人可以出现喉头发紧、呼吸困难。

 肝肾功能损害：几乎所有的化疗药都需经过肝脏代谢，肾脏排泄，所以都有可能损害肝肾功能。

 还会发生一些少见的毒副反应如过敏、皮疹、中枢神经毒性等。