药物是人类对抗疾病的有力武器。但刀有双刃，药物在治病的同时，对人体也有一定的影响。在使用药物的过程中，出现了与治病目的无关的其他反应，称为药物的不良反应，即药物的副作用。

杆菌肽在临床主要用于耐青霉素的葡萄球菌感染及外用于皮肤感染等。杆菌肽在水中易溶，在乙醇中溶解，在丙酮、氯仿或乙醚中不溶， 抗菌谱与青霉素相似，对革兰阳性细菌和阴性球菌、肺炎双球菌、葡萄球菌、淋球菌、脑膜炎双球菌及螺旋体等均有杀菌作用。其作用机制不仅作用于细胞壁，也影响原生质体，对胞浆膜也有损坏作用，影响其渗透性。 由于杆菌肽对肾脏毒性大，临床应用受到限制，一般不作全身用药。

使用杆菌肽会出现以下不良的反应：

1、杆菌肽局部用于腹腔手术或灌注于感染体腔用药量较大时，可有微量吸收，有引致肾毒性发生的可能。

2、过敏反应，皮肤局部瘙痒、皮疹、红肿或其他刺激现象，一般反应轻微。偶有局部用药后发生严重全身过敏反应者。

杆菌肽全身应用时，可引起严重肾毒性反应，受损部位以肾小管为最明显，肾小球的滤过功能也受到抑制，尿的异常发现于给药的第3～4日，至5～7日达高峰，以后虽继续用药，情况有时反见改善。随着蛋白尿、管型尿等的出现，肾功能也显示减退，严重者可发生急性肾小管坏死和死亡。由于它的毒性大，且其他具有同样疗效的低毒性抗生素的出现，故目前杆菌肽仅供局部使用。局部应用软膏时也有极少数病人产生过敏反应。

通常情况下杆菌肽局部应用并无明显吸收，但在应用较大剂量灌注入体腔或用于较大手术创面时可有微量吸收。口服杆菌肽后自胃肠道吸收亦不明显。

另外，对杆菌肽过敏者禁用，肾功能不全者禁用。孕妇及哺乳妇女慎用。肌注有发生肾小管、肾小球坏死的报道，应注意监测肾功能。